Separační toalety oddělují tekutý odpad od tuhého. Příčinou toho, že některé toalety zapáchají, je obvykle anaerobní rozklad přemokřené směsi. Oddělení moči od fekálií tak tento problém do značné míry řeší. Množství tuhého odpadu se tak redukuje až o 95% a perioda vynášení se výrazně prodlouží. Tuhý odpad je zachytáván do zásobníku kde dehydruje a po určité době se může použít jako kompost. Moč je svedena do odpadu, vsakovací jámy, kanystru nebo ejektortanku. Na rozdíl od fekálií je moč prakticky sterilní a není proto problém ji po naředění s vodou 1:8  používat přímo  k zálivce zahrady.

Tento typ toalety vyžaduje i po mužích, aby při použití toalety vždy seděli. Toalety mají totiž mísu vybavenou  jímačem moči, který zachytává moč pouze při užívání vsedě.

Televizní pořady - TV NOVA Rady ptáka Loskutáka 17.2.2008 Separační eko-toalety

Modely separačních ekotoalet:

Nová toaleta Torp Isak - je oddělovací separační toaleta do víkendových domů. Její design, stabilita, pohodlí a použití odpovídá všem novým požadavkům na moderní WC. Oddělením tekutého a tuhého odpadu nemůže vznikat „latrínový“ zápach. Pevný odpad se hromadí ve vnitřním zásobníku, kde dehydruje a po určité době se může použít jako kompost. Vestavěný 12 V tichý ventilátor rychle vysuší fekální odpad uvnitř v zásobníku a větrá Vaši toaletu a koupelnu. Nemá žádný požadavek na teplotu místnosti. Pro její vzhled a vlastnosti je doporučena pro užití v domácnosti. Pro objekty kde je k dispozici 230V je třeba adaptér 230 / 12 V. Ventilátor (1,9W, 160 mA) je možno připojit k baterii/ solárnímu zdroji. Operační čas pro 12V, 75Ah baterii je více jak 2 týdny bez nabíjení. Součástí dodávky je i 2x zásobník, 10 ks pytlů z bioplastu. Instalace této toalety je velmi jednoduchá. Vše co potřebujete je napájení 12 V (230 V), otvor pro odvětrávací potrubí a odvod pro tekutý odpad. 

Cena  12 800,- Kč   

Tento model vypadá jako klasická splachovací toaleta a má i stejný rozměr. Toaleta je vybavena krytem kompostu a poté co je otevřena vidíte pouze bílý kryt. Po usednutí na toaletu se kryt automaticky otevře a po použití zase zavře. Moč je pomocí disku, který je umístěn pod sedátkem oddělována od pevných výkalů. Potom je vyvedena mimo toaletu do odpadu, vsaku nebo ejektortanku.  Tuhý odpad u Seperera 30 je zachytáván ve vnitřním zásobníku, do kterého je vložen plastikový pytel. U Separera 40 je zásobník pod podlahou mimo toaletu, což umožňuje použít mnohem objemnější zásobník. Ventilátor 230V nebo 12V prohání vzduch toaletou, což způsobuje, že koupelna je zcela bez zápachu. Toaleta může pracovat i bez elektrické energie, ale pak je potřeba instalovat ventilační rouru z toalety směrem přes střechu za účelem vytvoření průvanu.

Cena 
Separera 30/230V  15 700,- Kč
Separera 30/12V    15 200,- Kč       
Separera 40           18 000,- Kč

Zakrytí kompostu toalety	Separera 30	Separera 40